Disciplinas

DISCIPLINAS OFERTADAS NO 2º SEMESTRE DE 2017

Código Nome créditos CH DATA início DATA fim Prof. responsável
BQ740 Seminários em Biotecnologia e Biocatálise 1 15 01/08/2017 20/12/2017 Nadia
BQ739 Seminários em Bioenergética e Metabolismo Celular 2 30 01/08/2017 20/12/2017 Sheila
BQ725 Métodos de Purificação de Proteínas 2 30 07/08/2017 18/08/2017 Leda Chubatsu
BQ741 Seminários em Glicobiologia 2 30 08/08/2017 30/11/2017 Maria Eugênia
BQ735 Regulação do Metabolismo Celular 2 30 14/08/2017 25/08/2017 Lucimara
BQ748 Tópicos Avançados em Bioquímica – Neuroquímica 2 30 14/08/2017 30/08/2017 Claudio
BQ700 Análise Conformacional de Proteínas 2 30 28/08/2017 01/09/2017 Beatriz
BQ721 Mecanismos de reações Bioquímicas 2 30 18/09/2017 20/12/2017 Diogo
BQ731 Radicais Livres em Sistemas Biológicos 2 30 16/10/2017 26/10/2017 Maria Eliane
BQ730 Química e físico-química de carboidratos 1 15 23/10/2017 27/10/2017 Carmen
BQ748 Tópicos Avançados em Bioquímica – Analise de Carboidratos por Espalhamento de Luz e Reologia 2 30  21/11/2017 30/11/2017 Joana
BQ714 Estrutura e Função de proteinas 2 30 04/12/2017 12/12/2017 Elaine
BQ746 Técnicas de Redação Científica

terças-feiras, das 17h00 às 19h00

2 30 01/08/2017 20/12/2017 David
BQ733 Redação de Artigos Científicos em Inglês

quintas-feiras, das 17h00 às 19h00

2 30 01/08/2017 20/12/2017 David

 

 

DISCIPLINAS OFERTADAS NO 1º SEMESTRE DE 2017

Código Nome créditos CH DATA início DATA fim Professor responsável
BQ741 Seminários em Glicolobiologia 2 30 03/04/2017 30/06/2017 Maria Eugênia
BQ740 Seminários em Biotecnologia e Biocatálise 1 15 03/04/2017 30/06/2017 Nadia
BQ729 Química de Biomoléculas 2 30 04/04/2017 13/04/2017 Glaucia
BQ719 Introdução ao trabalho experimental 2 30 10/04/2017 21/04/2017 Glaucia
BQ707 Carboidratos 1 15 24/04/2017 28/04/2017 Marcello
BQ717 Introdução a Bioinformática 3 45 02/05/2017 19/05/2017 Leonardo
BQ748 Fracionamento e Purificação de Biomoléculas 2 30 22/05/2017 02/06/2017 Rodrigo
BQ752 Transdução de Energia 2 30 22/05/2017 02/06/2017 Silvia
BQ701 Análise de Biopolímeros por Métodos Espectroscópicos 3 45 05/06/2017 16/06/2017 Guilherme
BQ704 Biologia Molecular 2 30 05/06/2017 16/06/2017 Rose Adele
BQ718 Cinética Enzimática 2 30 19/06/2017 30/06/2017 David
BQ709 Cultivo de Células Animais 2 30 26/06/2017 07/07/2017 Guilhermina

DISCIPLINAS OFERTADAS NO 2º SEMESTRE DE 2016

DISCIPLINAS OFERTADAS 2016 – 1º SEMESTRE

DISCIPLINAS OFERTADAS NO 2º SEMESTRE DE 2015

CURRÍCULO DE DISCIPLINAS e EMENTAS

Código Disciplinas Créditos Carga horária
BQ700 Análise Conformacional de Proteínas 02 30
BQ701 Análise de Biopolímeros por Métodos Espectroscópicos 03 45
BQ702 Análise Estrutural de Polissacarídeos 02 30
BQ703 Bioestatística Aplicada à Bioquímica 02 30
BQ704 Biologia Molecular 02 30
BQ705 Bioquímica da Fixação do Nitrogênio 02 30
BQ706 Bioquímica Farmacológica 02 30
BQ707 Carboidratos 01 15
BQ708 Cinética Enzimática Avançada 02 30
BQ709 Cultivo de Células Animais 02 30
BQ710 Ensino-Aprendizagem em Bioquímica 02 30
BQ711 Estágio de Docência em Bioquímica I 02 30
BQ712 Estágio de Docência em Bioquímica II 02 30
BQ713 Estágio de Docência em Bioquímica III 02 30
BQ714 Estrutura e Função de Proteínas 02 30
BQ715 Fisiologia de Microrganismos 03 45
BQ716 Glicobiologia 02 30
BQ717 Introdução a Bioinformática 03 45
BQ718 Introdução a Cinética Enzimática 02 30
BQ719 Introdução ao trabalho experimental 02 30
BQ720 Manipulação Gênica 02 30
BQ721 Mecanismos de Reações Bioquímicas 02 30
BQ722 Mecanismos de Sinalização Celular e Controle da Expressão Gênica 02 30
BQ723 Metabolismo de Carboidratos e Lipídeos 02 30
BQ724 Metodologias de Ensino de Bioquímica 02 30
BQ725 Métodos de Purificação de Proteínas 02 30
BQ726 Modelagem Matemática de Fenômenos Bioquímicos 03 45
BQ727 Propriedades de Mitocôndrias Animais e Vegetais 02 30
BQ728 Propriedades de Polissacarídeos Hidrossolúveis 01 15
BQ729 Química de Biomoléculas 02 30
BQ730 Química e Físico-Química de Carboidratos 01 15
BQ731 Radicais Livres em Sistemas Biológicos 02 30
BQ732 Radioisótopos Aplicados a Bioquímica 01 15
BQ733 Redação de Artigos Científicos em Inglês 02 30
BQ734 Regulação da Expressão Gênica 02 30
BQ735 Regulação do Metabolismo Celular 02 30
BQ736 Reparo de Lesões no DNA e Mutagênese 02 30
BQ739 Seminários em Bioenergética e Metabolismo Celular 02 30
BQ740 Seminários em Biotecnologia e Biocatálise 01 15
BQ741 Seminários em Glicolobiologia 02 30
BQ744 Sessão de Referatas III 02 30
BQ745 Técnicas de Análise Proteômica 02 30
BQ746 Técnicas de Redação Científica 02 30
BQ747 Tecnologia Enzimática e Biocatálise 03 45
BQ748 Tópicos Avançados em Bioquímica 02 30
BQ749 Tópicos Avançados em Bioquímica de Microrganismos 02 30
BQ750 Tópicos Avançados em GenômicaFuncional de Protozoários 02 30
BQ751 Tópicos Especiais em Manipulação da Expressão Gênica 02 30
BQ752 Transdução de Energia 02 30
BQ753 Sessão de Referatas Mestrado I 01 15
BQ754 Sessão de Referatas Mestrado II 01 15
BQ755 Sessão de Referatas Doutorado I 01 15
BQ756 Sessão de Referatas Doutorado II 01 15
BQ757 Sessão de Referatas Doutorado III 01 15
BQ758 Sessão de Referatas Doutorado IV 02 30
BQ759 Seminários de Tese Mestrado I 01 15
BQ760 Seminários de Tese Mestrado II 01 15
BQ761 Seminários de Tese Doutorado I 01 15
BQ762 Seminários de Tese Doutorado II 01 15
BQ763 Seminários de Tese Doutorado III 01 15
BQ764 Seminários de Tese Doutorado IV 01 15
BQ765 Seminários de Tese Doutorado V 01 15
BQ766 Seminários de Tese Doutorado VI 01 15

 


EMENTAS 

BQ700 – ANÁLISE CONFORMACIONAL DE PROTEÍNAS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Introdução a conformação de proteínas, cristalogêneses, preparação e cuidados com proteínas para cristalização, métodos de cristalização, montagem de cristais de proteína para coleta de dados, geradores de raios X, detetores de área, dados preliminares e simetria cristalográfica, processamento de dados, métodos de determinação de estrutura, substituição isomorfa múltipla, substituição molecular, dispersão anômala, promediação da densidade eletrônica e nivelamento do solvente, Métodos de refinamento do modelo cristalográfico, análise cristalográfica, análise de modelos estruturais, prática de cristalização de proteínas e análise de modelos estruturais.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BLUNDELL, T. L.; JOHNSON, L.N. Principles of Protein X-ray Crystallography. New York : Academic Press, 1994.

BRANDEN, C.; TOOZE, H.   Introduction to Protein Structure.  2ed. Garland   Publ. 1998.

CREIGTON,T.E. Protein structure: a practical approach. Oxford: IRL,1989.

DUCRUIX, A.; GIEGÉ, R.   Crystallization of Nucleic Acids and Proteins: a practical  approach.   Oxford : Oxford University Press, 2000.

DIFFRACTION. Methods for Biological Macromolecules. In: METHODS IN ENZYMOLOGY.   New York : Academic Press, 1985.  v.114/115

LATTMAN, E. E & LOLL, P. J. Protein Crystallograph: A concise guide. The John Hopkins University Press, 2008.

RHODES, G.  Crystallography Made Crystal Clear. 2ed.  New York :  Academic Press, 2000.

SHERWOOD, D. & COOPE, J.  Crystals, X-rays and Proteins: Comprehensive Protein Crystallography. Oxford University Press, 2010

VAN HOLDE, K. E.;  JOHNSON, C.; HO, P. S.  Principles of Physical Biochemistry. Prentice Hall, 1999.Artigos de periódicos especializados como: Nature, Science, Journal of Molecular Biology, Biochemistry, Cell.

METODOLOGIA: Seminários e discussão em grupo. Avaliação pelo desempenho nos seminários.

 

BQ701- ANÁLISE DE BIOPOLÍMEROS POR MÉTODOS ESPECTROSCÓPICOS

CRÉDITOS: 03

CARGA HORÁRIA: 45h

EMENTA: Análise de macromoléculas por meio de 1) ressonância magnética nuclear (NMR) mono- e bidimensional de carbono-13, hidrogênio e outros núcleos e 2) cromatografia gasosa acoplada à espectrometria de massas (GC-MS). Análise de carboidratos de baixo peso molecular utilizando a técnica de espectrometria de massas por electron sprayionization (ESI-MS) e cromatografia líquida de alta eficiência (detecção por índice de refração) acoplada à espectrometria de massas (HPLC-RID-MS). O curso é focalizado em moléculas que apresentam atividade biológica ou interesse industrial.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

GORIN, P.A.J.; MAZUREK, M. 1975. Further studies on the assignment of signals in C-13 magnetic resonance spectra of aldoses and derived methyl glycosides. 1975. Canadian Journal of Chemistry, 53, 1212-1223.

GORIN, P.A.J. 1981. Carbon-13 nuclear magnetic resonance spectroscopy of polysaccharides. Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry. 38, 13-104.

TISCHER, C.A.; GORIN, P.A.J.; IACOMINI, M. 2002. The free reducing sugars of gum arabic as aids for structural assignments in the polysaccharide. Carbohydrate Polymers, 47, 151-158.

SASSAKI, G.L.; GORIN, P.A.J.; SOUZA, L.M.; CZELUSNIAK, P.A.; IACOMINI, M. 2005. Rapid synthesis of partially O-methylated alditol acetate standards for GC-MS; some relative activities of hydroxyl groups of methyl glycopyranosides on Purdie methylation. Carbohydrate Research, 340, 731-739.

BARRETO-BERGTER, E.; SASSAKI, G.L.; SOUZA, L.M.; ROLLIN, R.R.; WAGNER, R.; BITTENCOURT, C.V.; LOPES, L.C.L.; SIMAS-TOSIN, F.F.; NOSEDA, M.D.; GORIN, P.A.J. 2011. Carbohydrate epitopes in glycoprotein from the opportunistic fungal pathogen, Scedosporium apiospermum. Carbohydrate Polymers, 85, 349-355.

METODOLOGIA: Aulas teóricas  e demonstrações práticas de GC-MS e RNM (1D e 2D). Avaliação feita por provas escritas e pelo desempenho nos seminários e discussões em grupo.

 

BQ702 – ANÁLISE ESTRUTURAL DE POLISSACARÍDEOS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Processos de purificação e de determinação de homogeneidade de polissacarídeos. Metodologia de fragmentação seletiva: hidrólise ácida parcial, acetólise e hidrólise enzimática. Métodos químicos e físico-químicos empregados na caracterização da estrutura fina de polissacarídeos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos científicos especializados, relacionados com o tema.

ASPINALL, G. O.  The Polysaccharides. New York : Academic Press, 1985. v.1-3

CHAPLIN,M.F. Carbohydrate analysis: practical approach 2.nd .Oxford: Oxford University Press,1994.

FERRIR, R. V. ; COLLINS, P.M.   Monosaccharides Chemistry,  1995

METODOLOGIA: Aulas teóricas, seminários (periódicos científicos especializados).    Avaliação do aprendizado pelo desempenho nos seminários e prova escrita.

 

BQ703 – BIOESTATÍSTICA APLICADA À BIOQUÍMICA

CRÉDITO: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Conceito de bioestatística. Medidas de tendência central. Medidas de dispersão. Probabilidade. Testes de comparação de médias (testes t). Comparação de proporções. Tabela de contingência. Teste c2. Teste de aderência. Análise de acurácia e concordância. Risco relativo. Correlação. Regressão linear. Regressão não linear. Análise da variância. Teste de Tukey para comparação de médias. Determinação da DL50. Erros. Controle estatístico de qualidade. Análise de sobrevivência. A estatística desempenha um papel importante na pesquisa bioquímica. A finalidade da disciplina é apresentar os princípios gerais da estatística e alguns problemas específicos da estatística aplicadas à área de saúde e biologia. O objetivo específico é apresentar uma abordagem prática, sem o tecnicismo empregado pelos estatísticos matemáticos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

DOWNING, D. e CLARK, J. Estatística. São Paulo:Saraiva, 1998

FLETCHER, R.H.; FLETCHER, S.W. e WAGNER, E.H. Epidemiologia clínica. 3a. ed. Porto Alegre:Artes Médicas, 1996.

FONSECA, J.; MARTINS, G. Curso de estatística, 5a. ed. São Paulo: Atlas, 1994.

JEKEL, J.F.; ELMORE, J.G. e KATS, D.L. Epidemiologia, bioestatística e Medicina preventiva.

Porto Alegre:Artes Médicas, 1999.

MILONE, G. ; ANGELINI, F. Estatística geral, São Paulo: Atlas, 1993.

OLIVEIRA, F. Estatística e probabilidade, São Paulo: Atlas, 1995.

RODRIGUES, P. C. Bioestatística. Niterói:EDUFF-Ed. Universitária Universidade F. Fluminense, 1993

PEREIRA, W. ; TANAKA, O. Estatística. Conceitos básicos, São Paulo: McGraw Hill, 1990.

ZAR, J.H. Biostatitical analysis 4 ed. New Jersey: Prentice Hall, 1999

METODOLOGIA: Aulas expositivas. Seminários e estudo dirigido. Avaliação por meio de provas escritas.

 

BQ704 – BIOLOGIA MOLECULAR

CRÉDITOS: 02 

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Estrutura de genes e cromossomas. Replicação e transcrição. Regulação da expressão gênica. Técnica de biologia molecular.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

ALBERTS, B.; LEWIS R. ; ROBERTS, W.  Molecular Biology of the Cell.  3.ed.  New York : Garland, 1994.

BECKWITH,J.;  SILHAVY,T .J. The Power of Bacterial Genetics. A literature based course.    New York : Cold Springer Harbor Press, 1992, 828p.

NELSON, D. L.; COX M. M. Lehninger: Princípios de Bioquímica, 5ª ed., São Paulo: Sarvier, 2008.

LEWIN, B. Genes VI. Oxford : Oxford University Press, 2006.

Trabalhos Científicos relacionados ao tema em periódicos especializados.

METODOLOGIA: Seminários. Avaliação pelo desempenho nos seminários e provas escritas.

 

BQ705 – BIOQUÍMICA DA FIXAÇÃO DO NITROGÊNIO

CRÉDITO: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Organismos fixadores de nitrogênio. O complexo nitrogenase. Nitrogenases alternativas. Energética da redução enzimática do nitrogênio. O modelo Lowe-Thorneley. Eficiência dos sistemas fixadores. Reciclagem do hidrogênio. Estrutura tridimensional das nitrogenases. Avanços recentes no entendimento das interações Fe/MoFe. Regulação da expressão de genes nif e da atividade da nitrogenase.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BALDANI, J.I., BALDANI, V.L. (2005) History on the biological nitrogen fixation research in graminaceous plants: special emphasis on the Brazilian experience. An. Acad. Bras. Cienc.  77(3):549-79.

BOYD, E.S., HAMILTON, T.L., PETERS, J.W. (2011). An alternative path for the evolution of biological nitrogen fixation. Front. Microbiol. 2:205

CICCOLELLA, C.O., RAYNARD, N.A., MEI, J.H., CHURCH, D.C., LUDWIG, R.A. (2010). Symbiotic legume nodules employ both rhizobial exo- and endo-hydrogenases to recycle hydrogen produced by nitrogen fixation. PLoS One. 5(8):e12094.

CHUBATSU, L.S.; MONTEIRO, R.A.; SOUZA, E.M.; OLIVEIRA, M.A.S.; YATES, M.G.; WASSEM, R.; BONATTO, A.C.; HUERGO, L.F.; STEFFENS, M.B.R.; RIGO, L.U.; PEDROSA, F.O. (2012) Nitrogen fixation control in Herbaspirillum seropedicae.  Plant Soil, 356:1-2 197-207.

DANCE I. Electronic dimensions of FeMo-co, the active site of nitrogenase, and its catalytic intermediates. (2011) Inorg Chem. 3 – 50(1):178-92.

DIXON R., KAHN D. (2004). Genetic regulation of biological nitrogen fixation. Nature Reviews Microbiology 2: 621-631.

de HOFF, P., HIRSCH, A.M. (2003) Nitrogen comes down to earth: report from the 5th European Nitrogen Fixation Conference. Mol Plant Microbe Interact.  16(5):371-5.

HAMILTON, T.L., LUDWIG ,M., DIXON, R., BOYD, E.S., DOS SANTOS, P.C., SETUBAL, J.C., BRYANT. D.A., DEAN, D.R., PETERS, J.W. (2011) Transcriptional profiling of nitrogen fixation in Azotobacter vinelandii. J. Bacteriol. 193(17):4477-86.

HERNANDEZ, J.A., GEORGE, S.J., RUBIO, L.M. (2009) Molybdenum trafficking for nitrogen fixation. Biochemistry  20 – 48 (41):9711-21.

MACLEAN, A.M., FINAN, T.M., SADOWSKY, M.J. (2007) Genomes of the symbiotic nitrogen-fixing bacteria of legumes. Plant Physiol. 144(2):615-22

LEE, C.C., HU, Y., RIBBE, M.W. (2009) Unique features of the nitrogenase VFe protein from Azotobacter vinelandii. Proc Natl Acad Sci U S A.  9 – 106(23):9209-14.

LEE, C.C., BLANK, M.A., FAY, A.W., YOSHIZAWA, J.M., HU, Y., HODGSON, K.O., HEDMAN, B., RIBBE, M.W. (2009) Stepwise formation of P-cluster in nitrogenase MoFe protein. Proc Natl Acad Sci U S A. 3 – 106 (44):18474-8.

POSTGATE, J.R.; HILL, S. Nitrogen fixation. In: LYNCH, J.M.; POOLE, N.J., eds. Microbial ecology, a concept approach. Oxford: Blackwell, p.191-213, 1979.

ROSENBLUETH, M., Martínez-Romero E. (2006) Bacterial endophytes and their interactions with hosts. Mol Plant Microbe Interact. 19(8):827-37.

SEEFELDT, L.C.; HOFFMAN, B,M,; DEAN, D.R. (2012) Electron transfer in nitrogenase catalysis. Curr Opin Chem Biol. 16(1-2):19-25.

SEEFELDT, L.C., HOFFMAN, B.M., DEAN, D.R. (2009) Mechanism of Mo-dependent nitrogenase. Annu Rev Biochem.  78:701-22.

METODOLOGIA: Aula expositiva e seminários. Avaliação do desempenho individual baseado na participação nos seminários e/ou prova escrita.

 

BQ706 – BIOQUÍMICA FARMACOLÓGICA

CRÉDITO: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Estudo sobre o mecanismo de ação de fármacos sobre o metabolismo energético mitocondrial e celular. Mecanismos de injúria celular quimicamente induzida, stress oxidativo, lipoperoxidação e mecanismos de proteção.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos atuais sobre o assunto em periódicos especializados como:Biochemical Pharmacology, European Journal of Pharmacology, Drug Metabolism and Disposition,Biochemical Pharmacology, Free Radical Biology & Medicine,Journal Applied Toxicology.

METODOLOGIA: Seminários, aulas teóricas e práticas. Avaliação do aprendizado pela participação nos seminários e aulas práticas e realização de provas escritas.

 

BQ707 – CARBOIDRATOS

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Estabelecer estruturas de monossacarídeos; determinação anomericidade a  e  b de monossacarídeos; importância da mutarrotação, reações de grupos anoméricos. Estruturas de oligossacarídeos, poder redutor e não redutor e principais reativos empregados na caracterização de monossacarídeos por cromatografia. Aplicação da oxidação por periodato e degradação de Smith em oligo e polissacarídeos. Emprego da metilação na caracterização estrutural de polissacarídeos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

ASPINAL, C. The polysaccharides. New York: Academic Press, 1985,  v. 1-3

COLLINS, P. M. Monosaccharides: their chemistry and their roles in natural products.  Chichester: J.Wiley,1995.

FERRIER, R. V.; COLLINS, P.M.   Monosaccharides chemistry.   London : Penguin Books, 1995.

MORRISON, R.T. ; BOYD, R. N. Organic Chemistry    Boston :  Allyn Bacon, 2008.

NELSON, D. L.; COX M. M. Lehninger: Princípios de Bioquímica, 5ª ed., São Paulo: Sarvier, 2008.

Artigos e revisões científicas em periódicos especializados como: Carbohydrate Research, Advances in Carbohydrate Chemistry, Carbohydrate Polymers.

METODOLOGIA: Aulas teóricas, mesas redondas e seminários. Avaliação através de prova escrita, com resolução de problemas sobre os assuntos desenvolvidos, além da participação nas atividades.

 

BQ708 – CINÉTICA ENZIMÁTICA AVANÇADA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Caracterização dos efeitos de temperatura e pH na atividade e estabilidade de enzimas. Dedução de equações cinéticas e interpretação de seus parâmetros. Planejamento e análise de experimentos para caracterizar reações enzimáticas de dois substratos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Cornish-Bowden, A. Fundamentals of Enzyme Kinetics, 2nd ed. Portland Press

METODOLOGIA:

Aulas teóricas. Aulas práticas. Avaliação do desempenho em provas escritas e provas práticas

 

BQ709 – CULTIVO DE CÉLULAS ANIMAIS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Preparo de Material para de Cultura de Células. Noções de biossegurança. Conceitos básicos da manipulação de cultivo celulares. Culturas Primárias e linhagens celulares. Comportamento das células em cultura. Fatores de crescimento. Transformação celular, oncogenes, genes supressores de tumores e adaptação metabólica das células tranasformadas. Criopreservação de células animais.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

MATHER, J.P. AND BARNES, D. Animal Cell Culture Methods. Methods in Cell Biology. Vol. 57. Academic Press, 1998.

ALBERTS et al. Biologia Molecular da Célula. B. 1997, 3a ed. Editora Artes Médicas, Porto Alegre, RS.

WEINBERG, R. A. A Biologia do Câncer. 2008. 1ª ed. Ed. Artmed.

MORAES, A. M., AUGUSTO, E.F. P., CASTILHO, L.D. Tecnologia de Cultivo de Células Animais: de Biofarmacos a Terapia Gênica. 2008, 1ª ed. Ed. Roca.

MASTERS, J. R. W. Animal Cell Culture. 3rd ed., Oxford University Press. 2000.315p.

Cell Biology, a Laboratory Handbook , J.E.Celis (vols. 1, 2 e 3) 2a Ed. 1999. Academic Press.

Basic Cell Culture, a Practical Approach, 1998, Ed. J.M.Davis, Oxford University Press.

Current Protocols in Molecular Biology, (vols. 1 e 2) 1988, Ed. F.M.Ausubel et al. John Wiley & Sons.

Artigos atuais relacionados em periódicos especializados.

METODOLOGIA: Aulas teóricas expositivas. Aulas práticas, nas quais os alunos tomarão contato com as técnicas básicas de cultivo, devendo executar alguns experimentos simples. Discussão, em grupo, dos resultados dos experimentos e das dificuldades encontradas na execução dos mesmos. Aulas práticas demonstrativas de técnicas mais elaboradas.

 

BQ710 – ENSINO-APRENDIZAGEM EM BIOQUÍMICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA:Teorias formais e pessoais de ensino-aprendizagem no ensino superior e suas implicações para o ensino de bioquímica. Metodologias alternativas de ensino-aprendizagem. Métodos de avaliação e suas influências na abordagem do aluno a sua aprendizagem.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

RAMSDEN, P. (1992). Learning to teach in higher education. London and New York: Routledge

Biochemical Education (www.sciencedirect.com)

Biochemistry and Molecular Biology Education (www.sciencedirect.com)

Vários artigos que tratam de assuntos relacionados ao ensino-aprendizagem, que serão distribuídas durante a disciplina.

METODOLOGIA: Leitura e discussão de literatura sobre ensino-aprendizagem no ensino superior. Discussão da leitura na sala de aula. Aulas conduzidas pelos próprios alunos. Redação de um ensaio sobre a teoria pessoal de ensino-aprendizagem.

 

BQ711 – ESTÁGIO DE DOCÊNCIA EM BIOQUÍMICA I

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Treinamento didático em Bioquímica.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

NELSON, D. L.; COX M. M. Lehninger: Princípios de Bioquímica, 5ª ed., São Paulo: Sarvier, 2008.

VOET D; VOET J.G. Bioquímica, 3ª ed, Porto Alegre: Artmed, 2006. 3ª ed.

THOMAS, M. D. Manual de Bioquímica com Correlações Clínica, 7ª ed.,  New York : Willey-Liss,  2011.

Artigos em periódicos especializados.

METODOLOGIA: Ministrar aulas práticas, sob a supervisão do responsável, participação  em avaliação parcial de conteúdos programáticos teóricos e práticos e aplicação de métodos ou técnicas pedagógicas como seminários e estudo dirigido. Obrigatória para os mestrandos.

 

BQ712 – ESTÁGIO DE DOCÊNCIA EM BIOQUÍMICA II

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Treinamento didático em Bioquímica.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

NELSON, D. L.; COX M. M. Lehninger: Princípios de Bioquímica, 5ª ed., São Paulo: Sarvier, 2008.

VOET D; VOET J.G. Bioquímica, 3ª ed, Porto Alegre: Artmed, 2006. 3ª ed.

THOMAS, M. D.  Manual de Bioquímica com Correlações Clínica, 7ª ed.,  New York : Willey-Liss,  2011.

Artigos em periódicos especializados.

METODOLOGIA: Ministrar aulas práticas, sob a supervisão do responsável, participação  em avaliação parcial de conteúdos programáticos teóricos e práticos e aplicação de métodos ou técnicas pedagógicas como seminários e estudo dirigido. Obrigatória para os doutorandos.

 

BQ713 – ESTÁGIO DE DOCÊNCIA EM BIOQUÍMICA III

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Treinamento didático em Bioquímica.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

NELSON, D. L.; COX M. M. Lehninger: Princípios de Bioquímica, 5ª ed., São Paulo: Sarvier, 2008.

VOET D; VOET J.G. Bioquímica, 3ª ed, Porto Alegre: Artmed, 2006. 3ª ed.

THOMAS, M. D. Manual de Bioquímica com Correlações Clínica, 7ª ed.,  New York : Willey-Liss,  2011.

Artigos em periódicos especializados.

METODOLOGIA: Ministrar aulas práticas ou módulos teóricos, sob a supervisão do responsável, participação  em avaliação parcial de conteúdos programáticos teóricos e práticos e aplicação de métodos ou técnicas pedagógicas como seminários e estudo dirigido. Optativa para os doutorandos

 

BQ714 – ESTRUTURA E FUNÇÃO DE PROTEÍNAS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Conceitos de estrutura primária a quaternária, arquitetura e enovelamento  de proteínas. Correlação de estrutura com função de proteínas utilizando proteínas fibrosas, globulares, enzimas. Manipulação de banco de dados de sequencia, estruturas de proteínas e programas de visualização de estrutura.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BRANDEN, C. ; TOOZE, H. Introduction to Protein Structure.   2ed. Garland   Publ. 1998.

DEVLIN, T.M. Manual de Bioquímica com correlações clínicas. Editora Edgard Blucher, 6a ed. 2006.

LESK, A. M. Protein Architeture: A Pratical Approach. Oxford University Press, 1991.

NELSON, D.L. AND COX, M.M. Lehninger – Princípios de Bioquímica. Ed. Sarvier, 4ªed. 2006.

PETSKO, G. A;   RINGE, D. Protein Structure and Function (Primers in Biology). New Science Press, 2004..

STRYER, L. Bioquímica, 4ª ed., Editora Guanabara Koogan, 1996.

VAN HOLDE, K. E.;  JOHNSON, C.; HO, P. S.  Principles of Physical Biochemistry. Prentice Hall, 1999

VOET, D.; VOET, J.G.; Pratt, C.W. Fundamentos de Bioquímica. Editora Artmed,  2000.

WHITFORD, D. Proteins: Structure and Function. John Wiley & Sons Ltd., 2005.

Artigos de periódicos especializados como: Nature, Science, Journal of Molecular Biology Biochemistry, Cell.

METODOLOGIA: Seminários e discussão em grupo. Avaliação pelo desempenho nos seminários.

 

BQ715 – FISIOLOGIA DE MICRORGANISMOS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Crescimento  microbiano.  Efeito  do  ambiente  na  atividade  microbiana. Diversidade  metabólica.  Microbiologia  Industrial.  Potencial  biotecnológico  dos microrganismos. Genômica, Metagenômica e análise da diversidade de microrganismos. Biologia Molecular da interação planta-bactéria.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

CAPPUCINO, J. G.; SHERMAN, N. Microbiology,  a laboratory manual  .   London : Addison Wesley ,1983.  p.466.

GERHARDT, P.  Methods for general and molecular bacteriology. Washington: ASM,1994, 791p.

KETCHM,P.  A.  ed.  Microbiology:  Concepts  and  applications. New York:  Wiley. Press,1988.

LEMKE, P. A. The Mycota. Ed. Kesser, Spinger-Verlag, Berlin, 1995. vol. II e III.

LENGELER,  J.  W.;  DREWS,  G.;  SCHLEGEL,  H.  G.  Biology of  the  Prokaryotes. Oxford: Blackwell, 1999, 955 p.

MALDELSTAM,  J.;   MCQUILLEN K.  Biochemistry  of Bacterial  Growth.  3rd ed.,London: Blackwell, 1982. 457p.

METODOLOGIA: Aulas teóricas e práticas em laboratório de Informática  sobre os tópicos abordados. Seminários e discussão de trabalhos  publicados em periódicos especializados. Avaliação: participação nas aulas, apresentação de seminários, prova e trabalhos práticos utilizando ferramentas computacionais.

 

BQ716 – GLICOBIOLOGIA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30

EMENTA: Diversidade estrutural, metabolismo, funções e aplicações bioquímicas de glicoconjugados. Relação entre estrutura-função de glicoconjugados. Modulação de processos de reconhecimento, sinalização e adesão célula-célula por glicoconjugados em diferentes sistemas biológicos. Técnicas analíticas utilizadas na glicobiologia.Objetivo: Estudar a estrutura e função de glicoconjugados.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

CASSAB, G. I. Plant cell wall proteins. Annu. Rev. Physiol. Plant Mol. Biol., v. 49, p. 281-309, 1998.

Chaplin, m.f.; Kennedy, J.F. (Eds.). 1994. Carbohydrates Analysis: A practical approach. Oxford: IRL Press, 2ª ed.

CUMMINGS, R. D. Use of lectins in analysis of glycoconjugates. In : Kaplan, N. O., Colowick, S. P. (eds.) Methods Enzymol., New York : Academic Press, 1994, v. 230, p. 66- 67.

FINCHER, G.B.; STONE, B.A.; CLARKE, A.E. Arabinogalactan-proteins: structure, biosynthesis, and function. Ann. Rev. Plant Physiol., Palo Alto, v. 34, p. 47-70, 1993.

FUKUDA, M.; KOBATA, A. (1993) Glycobiology: a practical approach, IRL Press, Oxford.

KHERSONSKY, S.M.; HO, C.M.; GARCIA, M.A.F.; CHANG, Y.T. Recent advances in glycomics and glycogenetics. Current Topics in Medicinal Chemistry, v. 3 (6), p 617-643, 2003.

NOTHNAGEL, E. A.; BACIC, A.; CLARKE, A. E. (Eds). (2000) Cell and developmental biology of arabinogalactan-proteins, Kluwer Academic Publishers/Plenum, Dordrecht, Netherlands/New York.

SOMMER-KNUDSEN, J.; BACIC, A.; CLARKE, A. E. Hydroxyproline-rich plant glycoproteins. Phytochemistry, v. 47, p 483-497, 1998.

VARKI, A.; CUMMINGS, R.D.; ESKO, J.D.; FREEZE, H.H.; STANLEY, P.; BERTOZZI, C.R.; HART, G.W.; ETZLER, M.E.Essentials of Glycobiology, 2nd ed. Plainview (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2008. (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/).

METODOLOGIA: Aulas expositivas, seminários e trabalho de laboratório. Avaliação do desempenho nas discussões e na apresentação dos seminários.

 

BQ717 – INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA

CREDITOS: 03

CARGA HORÁRIA: 45h

EMENTA: Noções básicas sobre Sistemas Operacionais baseados em Unix. Uso da Internet como ferramenta de pesquisa e análise para biólogos. Bancos de dados biológicos. Bioinformática na pesquisa Genômica estrutural e funcional. Programas e algoritmos para alinhamentos de sequências de DNA e proteínas, busca por similaridade de sequências, sequências reguladoras, motivos estruturais em sequências de proteínas e análise filogenética. Biologia de Sistemas.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

LOPES, H. S. L. & CRUZ, L. M. (editores). Computational biology and applied bioinformatics.

Publisher: InTech. 2011. 442 p. Disponível on line em http://www.intechopen.com/books/computational-biology-and-applied-bioinf…

LESK, A. M. Introdução à bioinformática. Artmed ed. 2008. 384 p.

BROWN, T. A. Genomes 3. Publisher: Garland Science. 2006. 736 p.

KOONIN, E. V. & GALPERIN, M. Y. Sequence – evolution – function: computational approaches in comparative genomics. Publisher: Kluwer Academic. 2003. 488 p. Disponível on line emhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK20260/

GIBAS, C. & JAMBECK, P. Desenvolvendo bioinformática – ferramentas de software para aplicações em biologia. Ed. Campus, Rio de Janeiro. 2001. 440p.

BAXEVANIS, A. D. & OUELLETTE, B. F. F. Bioinformatics – a practical guide to the analysis of genes and proteins. Wiley-Interscience, New York/ chichester/ Weinheim/ Brisbane/ singapore/Toronto. 2nd  ed. 2001. 370p.

METODOLOGIA: Aulas teóricas, discussão e apresentação de trabalhos. Aulas práticas com desenvolvimento de atividades e trabalhos envolvendo o conteúdo teórico.

 

BQ718 – INTRODUÇÃO À CINÉTICA ENZIMÁTICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Cinética de Michaelis-Menten. Equações cinéticas de reações reversíveis, inibição, cooperatividade e reações com dois substratos. Planejamento de experimentos cinéticos. Técnicas gráficas para a determinação da velocidade inicial da reação e a determinação dos parâmetros das equações cinéticas.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Cornish-Bowden, A. Fundamentals of Enzyme Kinetics, 3ed. Portland Press, 2004.

Cornish-Bowden, A. Analysis of enzyme kinetic data. Oxford University Press, 1995.

METODOLOGIA:Aulas teóricas. Aulas práticas. Avaliação do desempenho em provas escritas e provas práticas

 

BQ719 – INTRODUÇÃO AO TRABALHO EXPERIMENTAL

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Organização geral do laboratório, procedimentos e regras de segurança; configuração e uso de equipamentos do laboratório; organização de um experimento; cadernos de laboratório; apresentação pessoal e de suas pesquisas; preparo de reagentes e de tampões (utilização de balança e pHmetro); estoque e descarte de material (uso de refrigeradores e freezers); descarte de lixo do laboratório; técnica de manipulação asséptica/estéril e proteção do pesquisador; uso e manutenção de micropipetas e centrifugas; manuseio de material tóxico ou de risco biológico, uso e manutenção de rotaevaporadores e liofilizadores; preparo de amostras para análise de RMN.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Na bancada: manual de iniciação científica em laboratórios de pesquisas biomédicas / Kathy Baker; trad. Cristina M.M. Jeckel. Porto alegre: Artmed, 2002.

Métodos de laboratório em bioquímica / Adelar Bracht & Emy Luiza Ishii-Iwamoto, organizadores. Barueri, SP: Manole, 2003.

Artigos de revistas no tema para discussão.

METODOLOGIA: Aulas expositivas, estudos dirigidos e prática de laboratório. Avaliação por prova escrita e/ou seminários e relatórios.

 

BQ720 – MANIPULAÇÃO GÊNICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30

EMENTA: A natureza da informação genética. Isolamento, purificação e eletroforeses de ácidos nucleicos. Enzimas do metabolismo de ácidos nucleicos. Vetores gênicos. Clonagem, transferência e sequenciamento automático de genes. Identificação de clones. Amplificação de DNA por PCR.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BECKWITH,J.; SILHAVY,J.J.; The Power of Bacterial Genetics: A literature based course. New York: Cold Spring Harbor , 1992, 828p.

BROWN,T.A. Essential molecular biology: a practical approach: IRL,1991, 2v.

DIEFFENBACH, C.W.; DUEKSLER,G.S.    PCR Primer: A laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor , 1995,714p.

ERLICH,H.A. PCR technology : principles and applications for DNA amplification. New  York: W. H. Freeman, 1992.

GOEDDEL,D.V. Gene expression technology. New York, Academic Press,1991, 681p.

MILLER,J.R. Short course in bacterial genetics .New York: Cold Spring Harbour Press. 1992.

MILLER,J.H. Experiments in Molecular Genetics. New York: Cold Spring Harbour. Press.,1972.

MULLIS,K.B.; FERRÉ,F. GIBBS,R.;  PCR : The polymerase chain reaction. Boston: Birkhäuser, 1994,458p.

SAMBROOK, J.   Molecular cloning: a laboratory manual.   2.ed.   New York : Cold  Spring Harbor Lab., 1989.   3v.

METODOLOGIA:  Aulas teóricas e práticas. Avaliação por prova escrita.

 

BQ721 – MECANISMOS DE REAÇÕES BIOQUÍMICAS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Introdução ao mecanismo de reações; substituição nucleofílica alifática; eliminação-β; adição e subtituição na carbonila; mecanismos de reações enzimáticas e reações do metabolismo.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

ATKINS, P. AND JONES, L., 2001, Princípios de Química: questionando a vida moderna e o meio ambiente (Tradução da 1a ed.), Bookman, Porto Alegre, 873p.

BROWN, W.H.; FOOTE, C.S. and Iverson, B.L., 2005, Organic Chemistry, 4 ed., Thomson Learning, Inc., Belmont, 1169 p.

CAREY, F.A., 2001, Organic Chemistry, 4 ed., Mc Graw-Hill, 1103 p.

NELSON, D. L.; COX M. M. Lehninger: Princípios de Bioquímica, 5ª ed., São Paulo: Sarvier, 2008.

VOET D; VOET J.G. Bioquímica, 3ª ed, Porto Alegre: Artmed, 2006. 3ª ed.

SMITH, M.B. AND MARCH, J., 2001, March’s Advanced Organic Chemistry: reactions, mechanism and structure, 5 ed., John Wiley & Sons, Inc., New York, 2083p.

SYKES, P., 1985, Guide Book to Mechanism in Organic Chemistry, 6 ed., Longman, New York, 399 p.

SOLOMONS, T. W. G.; FRYHLE, C. B. Química orgânica Vol. 1. 9ª. Ed., Rio de Janeiro. LTC, 2009.

METODOLOGIA: Aulas expositivas e estudos dirigidos. Avaliação por provas escritas e seminários.

 

BQ722 – MECANISMOS DE SINALIZAÇÃO CELULAR E CONTROLE DA EXPRESSÃO GÊNICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Apresentação e discussão das principais vias de sinalização intracelular e mecanismos de controle da expressão gênica envolvidos em diferentes processos, tanto fisiológicos como patológicos. Serão abordados Fundamentos da Sinalização Celular. Receptores e Vias de Transdução de Sinal. Proteínas Quinases: vias de Ras-MAPKs. Fatores de Crescimento e Receptores de Tirosina Quinases. Proteínas Fosfatases. Receptores Integrinas. Redes de sinalização. Interação célula-célula e célula-matriz extracelular. Controle da expressão gênica e origem de neoplasias. Processos de Migração, Invasão e Metástase.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Cellular Signal Processing: An Introduction to the Molecular Mechanisms of Signal Transduction (2009) Friedrich Marks, Ursula Klingmüller & Karin Müller-Decker. Garland Science Taylor and Francis Group.

Structure and function in Cell Signaling (2008) John Nelson. John Wiley & Sons Ltd.

A Biologia do Câncer (2008) Robert A. Weinberg. Ed. Artmed.

Integração e seus Sinais (2000), Isaias Raw, Paulo Lee Ho, Ed. Unesp.

Leituras Complementares de Artigos Científicos (trabalhos originais e de revisões recentes) das Revistas Nature, Science, Cell, PNAS, JBC.

METODOLOGIA: Aulas teóricas. Discussão de artigos científicos – seminários.

Aproveitamento do curso será avaliado de acordo com a participação dos alunos nas discussões em aula, seminários e por meio de realização de provas escritas.

 

BQ723 – METABOLISMO DE CARBOIDRATOS E LIPÍDEOS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Estudo de tópicos específicos do metabolismo  de carboidratos e de lipídeos através da leitura e discussão da literatura com destaque para os mecanismos de interação e  inter relação com outras vias. Mecanismos de biossíntese e modificação de polissacarídeos. Metabolismo de lipoproteínas. Lipídeos de membranas e de função especializada.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos e Revisões sobre o assunto em periódicos especializados como: Annual Review of Biochemistry, Journal Biological Chemistry, Journal of Biochemistry e outros.

METODOLOGIA: Discussão em grupo e avaliação pela apresentação e participação  nos seminários e através de provas escritas.

 

BQ724 – METODOLOGIAS DE ENSINO EM BIOQUIMICA

CRÉDITOS: 2

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA:Técnicas de ensino em aulas teóricas de bioquímica. Preparação de um plano de aula, utilização efetiva de recursos audiovisuais. Experiência na sala de aula.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Biochemical Education (www.sciencedirect.com)

Biochemistry and Molecular Biology Education (www.sciencedirect.com)

METODOLOGIA: Aulas teóricas que envolvem a turma inteira da disciplina. Nestas aulas (a) serão discutidas técnicas de ensino para aulas teóricas de bioquímica. Nesta etapa cada aluno apresentará uma aula teórica de um assunto de bioquímica para a turma, e receberá críticas.

 

BQ725 – METODOS DE PURIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Escolha e preparo do material de partida; métodos de quantificação de proteínas; precipitação de proteínas; técnicas de cromatografias de troca-iônica, de interação hidrofóbica, de afinidade; resinas com corantes imobilizados; imunodetecção; outras técnicas utilizadas durante a purificação.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

DEUTSCHER, M.P. Guide to Protein Purification. in  Methods in Enzymology volume 182, Academic Press, 1990

HARRIS, E.L.V. & ANGAL, S. Protein purification methods – a practical approach. IRL Press Oxford University Press, 1989

COPES, R.K. Protein Purification, Principles and Practice, 3rd. edition, Springer, 1994

artigos científicos de periódicos internacionais relacionados ao tópico

METODOLOGIA: aulas expositivas, seminários de artigos relacionados, prova escrita

 

BQ726 – MODELAGEM MATEMÁTICA DE FENÔMENOS BIOQUÍMICOS

CRÉDITOS: 3

CARGA HORÁRIA: 45h

EMENTA:Análise de fenômenos bioquímicos e a formulação de equações para descrevê-los. Modelos algébricos e diferenciais e ferramentas computacionais para sua resolução. Estimação de parâmetros. Validação de modelos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BATCHELET, E. (1984). Introdução à Matemática para Biocientistas. Editora Interciência, Rio de Janeiro.

Artigos em periódicos no acervo da biblioteca do Setor de Ciências Biológicas

METODOLOGIA: Aulas teóricas. Estudos de caso. Aulas práticas realizadas no computador. Avaliação do desempenho em provas escritas e relatórios de estudos de caso.

 

BQ727 – PROPRIEDADES DE MITOCÔNDRIAS ANIMAIS E VEGETAIS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Estudo comparativo das propriedades de mitocôndrias vegetais e animais, com enfoque nos mecanismos de estresse e reposta celular a esta condição.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

NICHOLLS, D.G.; FERGUSON, S.J.   Bioenergetics-3.    London : Academic Press, 2002.

Artigos recentes publicados em revistas especializadas, como:Plant Physiology and Biochemistry,Plant Science,Physiologia Plantarum,Journal of Plant Physiology,Journal Biological Chemistry,Proceedings of National Academy of  Sciences,Archives in Biochemistry and Biophysics,Biochimica and Biophysica Acta,Biochemical Journal.

METODOLOGIA: Trabalhos de laboratório e discussão. Avaliação do aprendizado pela participação em aulas práticas, seminários, relatórios e provas escritas.

 

BQ728 – PROPRIEDADES DE POLISSACARÍDEOS HIDROSSOLÚVEIS

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: A estrutura fundamental dos polissacarídeos. Efeitos de modificações na estrutura primária sobre solubilidade, viscosidade e formação de gel. Alterações das propriedades reológicas causadas por interações macromoleculares, com solventes e sais. Análise conformacional a partir de técnicas de espalhamento de luz. Relação entre estrutura e propriedades físico-químicas dos polissacarídeos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

ASPINAL, C. The polysaccharides. New York : Academic Press,  1985.  v.1- 3

CHAPLIN,M.F. Carbohydrate analysis: practical approach. 2.ed.Oxford: Oxford

University Press, 1994.

YALPANI, M.   Polysaccharides: synthesis, modifications and structure/properties relations.  New York , 1988.

YALPANY, M.   Industrial polysaccharides.   New York : Elsevier, 1987

MILAS, M. ; DE GROOTE, R. ; CURVELO,A.A.S.   Polieletrólitos.  São Paulo, 1991

SCHRAMM, G. Reologia e Reometria: Fundamentos Teóricos e Práticos. São Paulo: Artiliber Ed., 2006.

BRINKER, C.J.; SCHERER, G.W. Sol-Gel Science: The physics and Chemistry of sol-gel Processing. San Diego, Acacemic Press, 1990.

LLOYD, L.L.; KENNEDY, J.F. and KNILL, C.J. Light scattering and chromatography in combination. In: BROWN, W. Light Scattering – Principles ad development. Oxford: Clarendon Press. 1996, p. 494-523.

REED, W.F. Data evaluation for unified multi-detector size exclusion chromatography – molar mass, viscosity and ratius of gyration distributions. Macromol. Chem. Phys, 196:1539-1575, 1995.

SUN, S.F. Physical chemistry of macromolecules – Basic Principles and Issues. New York: John Willey & Sons, Inc.. 1994.

METODOLOGIA: Avaliação do aprendizado pelo desempenho no decorrer dos seminários e prova escrita.

 

BQ729 – QUÍMICA DE BIOMOLÉCULAS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Ligações químicas em biomoléculas; Interações intermoleculares; Análise conformacional e estereoquímica; Termodinâmica e Equilíbrio químico; Ácidos e bases; Tampões; Reações de oxidação-redução.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

ATKINS, P. AND JONES, L., 2001, Princípios de Química: questionando a vida moderna e o meio ambiente (Tradução da 1a ed.), Bookman, Porto Alegre, 873p.

BROWN, W.H.; FOOTE, C.S. and Iverson, B.L., 2005, Organic Chemistry, 4 ed., Thomson Learning, Inc., Belmont, 1169 p.

NELSON, D.L. AND COX, M.M. Lehninger – Princípios de Bioquímica. Ed. Sarvier, 4ªed. 2006.

VOET, D.; VOET, J.G.; Pratt, C.W. Fundamentos de Bioquímica. Editora Artmed,  2000.

CAREY, F.A., 2001, Organic Chemistry, 4 ed., Mc Graw-Hill, 1103 p.

Solomons, T. W. G.; Fryhle, C. B. Química orgânica Vol. 1. 9ª. Ed., Rio de Janeiro. LTC, 2009.

METODOLOGIA: Aulas expositivas e estudos dirigidos. Avaliação por provas escritas e seminários.

 

BQ730 – QUÍMICA E FÍSICO-QUÍMICA DE CARBOIDRATOS

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Aplicação de métodos químicos, físicos, físico-químicos e cromatográficos na elucidação da estrutura e conformação de carboidratos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BIERMANN, C.J.; McGINNIS, G.D. Analysis of Carbohydrates by GLC and MS. Florida: CRC Press, 1989.

CHAPLIN, M.F.; .KENNEDY, J.F.  Carbohydrate Analysis.  New York: IRL Press, 1994.

COLLINS, P.; FERRIER, R.  Monosaccharides.   New York: John Wiley Press, 1995.

HOUNSELL, E. F. Methods in Molecular Biology. Glycoanalysis protocols. v.76. New Jersey, Humana Press, 1998.

MIKES, O.  Chromatographic methods.    London: D. van  Nostrand Co., 1996.

ROBYT, J.F. Essentials of Carbohydrate Chemistry. New York: Springer-Verlag, 1998.

ZWEIG, G.;  SHERMA, J.   CRC Handbook of chromatography.  Boca Raton: CRC Press, 1982.

Artigos científicos de periódicos especializados tais como: Carbohydrate Polymers, Carbohydrate Research, International Journal of Biological Macromolecules e Journal of Carbohydrate Chemistry.

METODOLOGIA: Aulas teóricas e seminários.

 

BQ731 – RADICAIS LIVRES EM SISTEMAS BIOLÓGICOS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Radicais livres e espécies reativas relacionadas. Defesas Antioxidantes. Papel dos radicais livres e outras espécies reativas em algumas doenças e no envelhecimento. Aplicações da ressonância paramagnética eletrônica. Metodologias utilizadas na determinação da atividade de enzimas antioxidantes e na detecção de produtos de oxidação de biomoléculas. Consequências do estresse oxidativo: reparo e sinalização celular.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

HALLIWELL, B. & GUTTERIDGE, J. M. C. Free Radicals in Biology and Medicine.

Oxford University Press, fourth edition, 2007.

AUGUSTO, O . Radicais Livres: Bons, maus e naturais. 1. ed. São Paulo: Oficina de Textos, 2006, 115p.

HERMES-LIMA, M. Oxygen in biology and biochemistry: role of free radicals .. In: K.B. Storey. (Org.). Functional Metabolism: Regulation and Adaptation. Functional Metabolism: Regulation and Adaptation. Hobocken, New Jersey: John Wiley & Sons, 2004, p. 319-368.

HERMES-LIMA, M. Oxidative stress and medical sciences. In: K.B. Storey;. (Org.). Functional Metabolism: Regulation and Adaptation. Functional Metabolism: Regulation and Adaptation. Hoboken, New Jersey: John Wiley & Sons, Inc., 2004, p. 369-382.

Artigos recentes da literatura especializada incluindo artigos da Free Radicals Biology & Medicine.

METODOLOGIA: Aulas teóricas com discussão de artigos. Avaliação do aprendizado por prova escrita e/ou seminários.

 

BQ732 – RADIOISÓTOPOS APLICADOS A BIOQUÍMICA

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Revisão de conceitos de física. O átomo, notação. Radioatividade. Formas de  desintegração. Cinética da desintegração. Interação de radiações com a matéria. Dosimetria, dose, exposição, dose equivalente. Radiobiologia. Radioproteção. Problemas genéricos  da aplicação de radionuclídeos. Traçador e fonte de radiação. Aplicação de radioisótopos em química e bioquímica.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BACH, S.W.  Radioisótopos  e Radiação. Curitiba : UFPR, 1987.

BOYER, R.F.   Modern Experimental Biochemistry.  2nd. ed. Melo Park : The Benjamin/Cummings, 1993.

FISCHER, W. ; FAUSTO, A.M.F.; ALDRED, M.P.; PAES, W. S. ; SANTELLI, R.V.;CAPURRO, M. L.  Radioatividade e Radioproteção: manual da Universidade deSão Paulo, 1994

RADIATION Safety Training. Manual da Segurança da Universidade da California. Berkeley, 1990

METODOLOGIA: Aulas teóricas, seminários e trabalho de laboratório. Avaliação do aprendizado pelo desempenho no decorrer dos trabalhos e pelo relatório final.

 

BQ733 – REDAÇÃO DE ARTIGOS CIENTÍFICOS EM INGLÊS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: A estrutura lógica de artigos científicos; o processo de publicação; expressão de idéias científicas em inglês. Análise da qualidade da redação em inglês.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

ALLEY, M. The Craft of Scientific Writing, 3a ed. Springer, 1996

Artigos em periódicos no acervo da biblioteca do Setor de Ciências Biológicas

METODOLOGIA: Análise de textos científicos na sala de aula. Exercícios e tarefas de redação em inglês. Avaliação pela participação nas discussões, redação de texto científico em inglês e análise de um artigo.

 

BQ734 – REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA

CRÉDITOS : 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Regulação da expressão e controle da síntese de proteínas em procariotos.   Operon Lac, Operon Trp. Sistemas ntr e nif.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

BERG, J. M.; STRYER, L.; TYMOCZKO, J. L. Bioquímica. 6. ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2008.

CHUBATSU, L.S.; MONTEIRO, R.A.; SOUZA, E.M.; OLIVEIRA, M.A.S.; YATES, M.G.; WASSEM, R.; BONATTO, A.C.; HUERGO, L.F.; STEFFENS, M.B.R.; RIGO, L.U.; PEDROSA, F.O. (2012) Nitrogen fixation control in Herbaspirillum seropedicae.  Plant Soil, 356:1-2 197-207.

LEWIN,B. Genes IX. Oxford University Press, New York, Cell Press, Cambridge, 2008.

LI W, LU CD. (2007). Regulation of carbon and nitrogen utilization by CbrAB and NtrBC two-component systems inPseudomonas aeruginosa. J. Bacteriol., 189(15):5413-20.

MERINO,  E.,   JENSEN, R. Y.,  YANOFSKY, C. (2008).  Evolution of bacterial trp operons and their regulation. Curr Opin Microbiol.  11(2): 78–86.

PTASHNE,M. A. Genetic Switch: Gene control and phage lambda. Cell Press/Black

Well Scientific Publication, Cambridge, Palo Alto, 1987.

SAVAGEAU, M. A.  (2011)  Design of the lac gene circuit revisited. Math Biosci. 231(1): 19–38.

YONGLIANG, Y., SHUZHEN, P., JUNPING, P., YUNLEI, H., LIANG, L., JIAN Y., YUETAN, D., YAN, L., HUILI, F., YING, F., DANHUA, L., YUHUA, Z., MING, C., WEI, L., WEI, Z., QUI, C., Q. J., MIN, L. (2010). Global transcriptional analysis of nitrogen fixation and ammonium repression in root-associated Pseudomonas stutzeri A1501. BMC Genomics. 11: 11.

Artigos recentes da literatura especializada.

METODOLOGIA : Aula expositiva e seminários. Avaliação do desempenho individual baseado na participação nos seminários e/ou prova escrita.

 

BQ735 – REGULAÇÃO DO METABOLISMO CELULAR

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Metabolismo de moléculas sinais e a sua participação na regulação das vias metabólicas e na expressão gênica. Análise de trabalhos originais sobre o tema.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos especializados publicados em periódicos especializados como:Science, Nature, Journal of Biological Chemistry, Proceedings of National Academy of Sciences, Archives in Biochemistry and Biophysics, Biochimica and Biophysica Acta, Biochemical Journal, European Journal of Biochemistry Journal of Bacteriology.

METODOLOGIA: Discussão em grupo. Avaliação pela participação nas discussões e análise escrita de dados da literatura.

 

BQ736 – REPARO DE LESÕES NO DNA E MUTAGÊNESE

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Lesões na molécula de DNA; mutagênese; reparo de lesões no DNA através de reversão do dano; reparo por excisão de base; reparo por excisão de nucleotídeos; “mismacth repair”; resposta SOS em procariotos; tolerância a lesões no DNA em eucariotos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Chaney sg, Sancar A. DNA repair: enzymatic mechanisms and relevance to drug response. J Natl Cancer Inst. 2:88(19):1346-60, 1996

COX MM. Better chemistry for better survival, through regulation. Cell, 112:286-7, 2003. (Comment in: Cell 112:391-401, 2003)

LUSETTI, SL.; COX, M.M. The bacterial RecA protein and the recombinational DNA repair of stalled replication forks. Annu. Ver. Biochem. 71:71-100, 2002

OGRUNC M., BECKER DF., RAGSDALE SW.,  SANCAR  A. Nucleotide excision repair in the third kingdom. J. Bacteriol., 180:5796-8, 1998.

SUNCAR  A. DNA excision repair . Annu Ver Biochem  65:43-81, 1996

WOOD, R. DNA repair in eucariotes. Annu ver biochem. 65:135-167, 1996

METODOLOGIA: Aulas expositivas; seminários; apresentação e discussão de artigos relacionados. Avaliação baseada em prova escrita e na participação durante as apresentações e discussões.

 

BQ739 – SEMINÁRIOS EM BIOENERGÉTICA E METABOLISMO CELULAR

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Discussão de artigos científicos atuais de alto índice de impacto e seminários relacionados à bioenergética mitocondrial (plantas e animais), efeitos de xenobióticos sobre o metabolismo celular, com enfoque em ciclo celular e sua regulação, vias de sinalização, estresse oxidativo e mecanismos de morte.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos de revitas especializadas como: Apoptosis,Archives of Biochemistry and Biophysics, Biochemical Pharmacology, Biochimica et Biophysica Acta, Bioorganic and Medicinal Chemistry

Cancer Research, Cancer Letters,Cell,Chemico-Biological Interactions, FEBS letters,Free Radical Biology and Medicine,Journal of Biochemistry,Journal of Bioenergetics and Biomembranes, Journal of Biological Chemistry,Journal of Cell Biology Molecular Cell Biology, Nature,Proceedings of the National Academy of Sciences,Science, Toxicology letters.

METODOLOGIA: Seminários e discussão em grupo. Avaliação pelo desempenho nos seminários.

 

BQ740 – SEMINÁRIOS EM BIOTECNOLOGIA E BIOCATÁLISE

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação de seminários em biotecnologia e biocatálise. Conteúdo Programático: aspectos de produção e caracterização de enzimas e micro-organismos e sua recuperação do meio de fermentação (downstream processing); imobilização de enzimas e de células inteiras; enzimas e micro-organismos em meios aquo-restritos; desenvolvimento de aplicações de biocatalisadores; metabólitos de interesse industrial produzidos por micro-organismos; novas fontes e melhoramento de biocatalisadores através de técnicas de engenharia genética; biorreatores, modelagem matemática aplicada ao desenvolvimento de processos e produtos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos da literatura especializada e projetos de pesquisa dos alunos envolvidos.

METODOLOGIA: Apresentação de seminários, com discussão dos artigos de literatura e projetos apresentados. Avaliação através da qualidade dos seminários apresentados e da discussão e interpretação dos resultados.

 

BQ741 – SEMINÁRIOS EM GLICOBIOLOGIA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Apresentação e discussão de artigos científicos atuais de alto impacto nas áreas de biotecnologia, bioquímica e química de carboidratos e glicoconjugados.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

Os artigos para apresentação serão selecionados das publicações citadas a seguir (eventualmente outros periódicos de interesse poderão ser utilizados): Biomacromolecules, Biopolymers, Bioresource Technology,Biotechnology Advances,Carbohydrate Polymers, Carbohydrate Research, Food Hydrocolloids, Glycobiology, International Journal of Biological Macromolecules, Journal of Bioscience and Bioengineering, Journal of Biological Chemistry, Journal of Biotechnology, Journal of Natural Products, Journal of Organic Chemistry, Macromolecules,Nature Biotechnology,Organic and Biomolecular Chemistry, Phytochemistry.

METODOLOGIA: Seminários e discussão em grupo. Avaliação pelo desempenho nos seminários e participação.

 

 

BQ744 – SESSÃO DE REFERATAS III

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Revisão da literatura internacional atual em bioquímica e biologia molecular. Apresentação individual obrigatória de 01 seminário referente a artigo publicado em periódico indexado, de circulação internacional, com fator de impacto igual ou superior a 5.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos publicados em periódicos indexados, de circulação internacional, com fator de impacto igual ou superior a 5 e no ano em curso.

METODOLOGIA: O aluno buscará artigo em periódicos especializados recomendados e escolherá no mínimo três opções que deverão ser avaliados por um dos professores da disciplina. O artigo escolhido será apresentado em data pré-determinada. A moderação das discussões ficará a cargo dos docentes da disciplina.

 

BQ745 – TÉCNICAS DE ANÁLISE PROTEÔMICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Eletroforese bidimensional de proteínas. Análise de géis bidimensionais utilizando o programa ImageMaster. Introdução à espectrometria de massa do tipo MALDI-TOF MS e MALDI-TOF-TOF MS/MS. Identificação de proteínas por PMF (peptide mass fingerprint) e por espetros MS/MS. Programas de identificação de proteínas utilizando espetros de massa.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Proteomics in PracticeA laboratory Manual of Proteome Analysis.  Wiley-VCH, 2004. p.261; 5.

Revistas científicas: Anal. Chimica Acta, Journal of Proteomics, Microbiol. Mol. Biol. Rev.,Proc. Natl. Acad. Sci.,Nature, Proteomics,Internat. J Proteomics

METODOLOGIA: Aulas teóricas sobre espectrometria de massa do tipo Maldi-Tof MS e Maldi-Tof-Tof MS/MS. Análise de géis bidimensionais e espectros de massa utilizando programas específicos como FlexAnalysis. Identificação de proteínas utilizando os programas Mascot e Protein-Prospector.

BQ746 – TÉCNICAS DE REDAÇÃO CIENTÍFICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Parte I: Discussão dos objetivos de vários veículos de comunicação científica redigida (com ênfase em projetos e dissertações/teses); análise da estrutura lógica destes documentos; construção de argumento lógico; técnicas de redação para maximizar a clareza da mensagem; análise crítica da literatura. Parte II; redação de um projeto ou dissertação/tese ou artigo científico, análise crítica de documentos redigidos por outros alunos.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

GOPEN, G.D.; SWAN, J.A. The science of scientific writing. American Scientist v. 78, p. 550-558, 1990.

Acervo de dissertações e teses da biblioteca do Setor de Ciências Biológicas

METODOLOGIA: Análise e discussão em aula de amostras de redação, exercícios de redação. Avaliação com base na participação nas aulas, nos documentos redigidos durante a disciplina e prova escrita.

 

BQ747 – TECNOLOGIA ENZIMÁTICA E BIOCATÁLISE

CRÉDITOS: 03

CARGA HORÁRIA: 45h

EMENTA: Aspectos básicos e aplicados da biocatálise: produção e caracterização de biocatalisadores, estudo dos mecanismos de atuação de biocatalisadores em meio aquoso e em meios não-convencionais (aquo-restritos). Aplicações da biocatálise. Conteúdo Programático: 1) Técnicas de produção de enzimas. 2) Produção de enzimas e sua recuperação do meio de fermentação (downstream processing). 3) Imobilização de enzimas. 4) Tipos de reações catalisadas por enzimas: a) reações de hidrólise e de condensação; b) reações de redução; c) reações de oxidação. 5) Enzimas em meios nãoconvencionais: a escolha do meio reacional (solventes orgânicos, líquidos iônicos, fluidos supercríticos), e do sistema reacional; as enzimas mais utilizadas e suas características, cinética enzimática em meios não-convencionais. (6) Biocatálise com células inteiras de microrganismos. (7) Aplicação de biocatalisadores para a geração de produtos de alto valor agregado. (8) Técnicas de engenharia genética aplicadas ao desenvolvimento de biocatalisadores: metagenômica, mutagênese sítio-dirigida, evolução dirigida.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos da literatura especializada.

BUCHHOLZ K., KASCHE V., BORNSCHEUER U. T. Biocatalysts and Enzyme Technology. WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, 2005

BOMMARIUS, A.S, RIEBEL, B.R, Biocatalysis: Fundamentals and Applications, WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, 2004

FABER, K. Biotransformations in Organic Chemistry: A Textbook. 4th ed. Heidelberg, Springer-Verlag, 2000.

STRAATHOF, A. J. J.; ADLERCREUTZ, P. Applied Biocatalysis. 2nd ed. Amsterdam,  Harwood Academic Publishers, 2000.

SILVERMAN, R. B. The Organic Chemistry of Enzyme-Catalyzed Reactions. 2nd ed. London : Academic Press, 2002.

LEHNINGER, A.L.; NELSON, D.L.; COX, M.M.  Princípios de Bioquímica. 3. ed. São Paulo : Sarvier, 2008.

ROBERTS, S. M.; TURNER, N. J.; WILLETTS, A. J.; TURNER, M. K. Introduction to Biocatalysis Using Enzymes and Microorganisms. New York : Cambridge University Press, 1995.

CORNISH-BOWDEN, A. Fundamentals of Enzyme Kinetics. London : Portland Press, 1995.

METODOLOGIA: Aulas teóricas, com  discussão de aspectos básicos voltados à produção e aplicação de enzimas e microrganismos em biocatálise. Discussão de artigos da literatura. Apresentação de seminários pelos alunos, com avaliação através de seminários e provas teóricas.

 

BQ748 -TÓPICOS AVANÇADOS EM BIOQUÍMICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Apresentação e discussão de trabalhos relevantes na área de Bioquímica.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Artigos especializados publicados em periódicos especializados como:Science, Nature, Journal of Biological Chemistry, Proceedings of National Academy of Sciences, Archives in Biochemistry and Biophysics, Biochimica and Biophysica Acta, Biochemical Journal, European Journal of Biochemistry Journal of Bacteriology

METODOLOGIA: Seminários individuais e discussão em grupo. Avaliação pela apresentação e análise de resultados da literatura.

 

BQ749 – TÓPICOS AVANÇADOS EM BIOQUÍMICA DE MICRORGANISMOS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Discussão de artigos científicos atuais de alto impacto na área de bioquímica de microrganismos com ênfase em: Controle do metabolismo de nitrogênio. Biodiversidade. metagenômica, interação planta – bactéria.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

Revistas científicas que serão utilizadas: Molecular Microbiology,Journal of Biological Chemistry,Journal of Bacteriology,Nature Reviews in Microbiology,FEMS Microbiology Letters, Proceedings of the National Academy of Sciences, Annual Review in Microbiology,Trends in Microbiology, Microbiology and Molecular Biology Reviews,Biochemistry,Journal of Biotechnology, Applied and Environmental Microbiology, Molecular Plant-Microbe Interaction,Soil Biology and Biochemistry, FEMS Environmental, Environmental Microbiology.

METODOLOGIA: Seminários e discussão em grupo. Avaliação pelo desempenho nos seminários e participação.

 

BQ750 – TÓPICOS AVANÇADOS EM GENÔMICA FUNCIONAL DE PROTOZOÁRIOS

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Estudo dos eventos moleculares de virulência, regulação da expressão gênica e função proteica com enfase em protozoários.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Publicações atuais em revistas de elevado fator de impacto, tais como: Science, Nature, Plos Negleted Diseases, Plos Pathogens, PNAS, Cell, Embo Journal, entre outras.

METODOLOGIA: Apresentação de artigos na forma de seminário seguida de discussão do tema apresentado.

 

BQ751 – TÓPICOS ESPECIAIS EM MANIPULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30

EMENTA: Estudo de mecanismos eucarióticos de regulação gênica e suas aplicações potenciais em terapia gênica, biologia sintética e genômica funcional. Referências bibliográficas

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

Artigos recentes publicados em revistas como: EMBO Journal, Journal of Biological Chemistry, Nature, Nature Genetics, Nature Medicine, PLoS Biology, PLoS Genetics, PLoS Medicine, PLoS Pathogens, Proceedings of National Academy of Science, Science.

METODOLOGIA: Apresentação de artigos, seguida de discussões moderadas pelo professor responsável.

 

BQ752 – TRANSDUÇÃO DE ENERGIA

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Conceitos de bioenergética. Membranas transdutoras de energia; processos de transporte; translocadores, protonóforos e ionóforos; complexos enzimáticos da cadeia respiratória; fosforilação oxidativa; partículas submitocondriais; controle da respiração mitocondrial e síntese de ATP.

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

NICHOLLS, D.G.; FERGUSON, S.J.   Bioenergetics-3.    London: Academic Press, 2002.

Artigos recentes da literatura especializada.

METODOLOGIA: Seminários e aulas teóricas. Discussões em grupo. Avaliação do aprendizado pela participação nos seminários e realização de provas com resolução de problemas e análise de artigos da literatura.

 

BQ753 SESSÃO DE REFERATAS MESTRADO I

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Revisão atual da literatura científica internacional. Apresentação individual de seminários pelos mestrandos)

METODOLOGIA: “Apresentação semanal de trabalhos da literatura especializada. A moderação das discussões ficará a cargo de docentes do Programa. Obrigatória para os mestrandos”.

 

BQ754 SESSÃO DE REFERATAS MESTRADO II

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Revisão atual da literatura científica internacional. Apresentação individual de seminários pelos mestrandos

METODOLOGIA: “Apresentação semanal de trabalhos da literatura especializada. A moderação das discussões ficará a cargo de docentes do Programa. Obrigatória para os mestrandos. Apresentação de 1 referata”

 

BQ755 SESSÃO DE REFERATAS DOUTORADO I

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Revisão atual da literatura científica internacional. Apresentação individual de seminários pelos doutorandos.

METODOLOGIA: “Apresentação semanal de trabalhos da literatura especializada. A moderação das discussões ficará a cargo de docentes do Programa. Obrigatória para os doutorandos.

 

BQ756 SESSÃO DE REFERATAS DOUTORADO II

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Revisão atual da literatura científica internacional. Apresentação individual de seminários pelos doutorandos.

METODOLOGIA: “Apresentação semanal de trabalhos da literatura especializada. A moderação das discussões ficará a cargo de docentes do Programa. Obrigatória para os doutorandos.

 

BQ757 SESSÃO DE REFERATAS DOUTORADO III

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Revisão atual da literatura científica internacional. Apresentação individual de seminários pelos doutorandos.

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos da literatura especializada. A moderação das discussões ficará a cargo de docentes do Curso. Obrigatória para os doutorandos.

 

BQ758 SESSÃO DE REFERATAS DOUTORADO IV

CRÉDITOS: 02

CARGA HORÁRIA: 30h

EMENTA: Revisão atual da literatura científica internacional. Apresentação individual de seminários pelos doutorandos.

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos da literatura especializada. A moderação das discussões ficará a cargo de docentes do Curso. Obrigatória para os doutorandos.

 

BQ759 SEMINÁRIOS DE TESE MESTRADO I

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de mestrado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de pesquisa. A avaliação será feita em função da presença e participação nas discussões gerais. Obrigatória para os mestrandos;

 

BQ760 SEMINÁRIOS DE TESE MESTRADO II

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de mestrado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de pesquisa. A avaliação será feita em função da apresentação do próprio seminário, pela presença e participação nas discussões gerais. Obrigatória para os mestrandos. Apresentação de 1 seminário.

 

BQ761 SEMINÁRIOS DE TESE DOUTORADO I

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de doutorado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de tese. A moderação das discussões ficará a cargo do orientador do expositor. Obrigatória para os doutorandos. A avaliação será feita em função da presença e participação nas discussões gerais;

 

BQ762 SEMINÁRIOS DE TESE DOUTORADO II

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de doutorado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de tese. A moderação das discussões ficará a cargo do orientador do expositor. Obrigatória para os doutorandos. A avaliação será feita em função da apresentação do próprio seminário, pela presença e participação nas discussões gerais. Apresentação de 1 seminário.

 

BQ763 SEMINÁRIOS DE TESE DOUTORADO III

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de doutorado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de tese. A moderação das discussões ficará a cargo do orientador do expositor. Obrigatória para os doutorandos. A avaliação será feita em função da presença e participação nas discussões gerais;

 

BQ764 SEMINÁRIOS DE TESE DOUTORADO IV

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de doutorado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de tese. A moderação das discussões ficará a cargo do orientador do expositor. Obrigatória para os doutorandos. A avaliação será feita em função da apresentação do próprio seminário, pela presença e participação nas discussões gerais. Apresentação de 1 seminário.

 

BQ765 SEMINÁRIOS DE TESE DOUTORADO V

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de doutorado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de tese. A moderação das discussões ficará a cargo do orientador do expositor. Obrigatória para os doutorandos. A avaliação será feita em função da presença e participação nas discussões gerais;

 

BQ766 SEMINÁRIOS DE TESE DOUTORADO VI

CRÉDITOS: 01

CARGA HORÁRIA: 15h

EMENTA: Apresentação individual pelos alunos de doutorado, de seus trabalhos de tese sob a supervisão dos respectivos orientadores

METODOLOGIA: Apresentação semanal de trabalhos de tese. A moderação das discussões ficará a cargo do orientador do expositor. Obrigatória para os doutorandos. A avaliação será feita em função da apresentação do próprio seminário, pela presença e participação nas discussões gerais. Apresentação de 1 seminário.