A maioria das aulas e dos seminários do PPGCF são ministrados nas dependências da Sede Botânico, do Setor de Ciências da Saúde, da Universidade Federal do Paraná, com amplas salas de aula e dois anfiteatros (120 e 250 lugares), todos equipados com projetores multimídia e facilidades de acesso à internet para projeções on line.
Farmácia é uma área essencialmente prática, sendo importante que o treinamento para a formação de mestre ou doutor em Ciências Farmacêuticas seja feito em laboratórios equipados e com as facilidades necessárias para o desenvolvimento do trabalho de pesquisa. O Programa conta com vinte amplos laboratórios, em diversas áreas do conhecimento da Farmácia, onde os alunos desenvolvem seus trabalhos de pesquisa. Cada laboratório tem seus equipamentos e materiais próprios, especializados para cada área em particular.
O PPGCF tem uma Central analítica equipada com equipamentos como HPLC, ultravioleta, infravermelho entre outros, e pessoal técnico capacitado para o desenvolvimento dos projetos de pesquisa de iniciação científica, especialização, mestrado e doutorado.
A Sede Botânico, do Setor de Ciências da Saúde, conta com amplo laboratório de informática, com dezesseis computadores ligados à rede internet, para uso dos alunos de graduação e pós-graduação. Além deste, todos os laboratórios de pesquisa têm seus próprios equipamentos com acesso on line ao Portal de Periódicos da CAPES.
A Sede Botânico possui uma excelente biblioteca com livros e periódicos das diversas áreas das ciências farmacêuticas, disponibilizados aos alunos do PPGCF.
O sistema integrado de bibliotecas da UFPR oferece a oportunidade ao aluno de pós-graduação frequentar e retirar livros nas quinze bibliotecas do sistema. Também está disponível, através do Portal da Informação, um serviço eficiente de acesso on line a diversos periódicos.